Offre de thèse
CD - Lymphocytes T gamma delta exprimant un récepteur chimérique d'antigène anti-CD7 : développement et caractérisation d'une immunothérapie allogénique de la leucémie aiguë lymphoblastique T
Date limite de candidature
09-06-2026
Date de début de contrat
01-10-2026
Directeur de thèse
DECOT Véronique
Encadrement
Le co-encadrement sera effectué avec le Dr Cécile Pochon, Chef de service d'onco-hématologie pédiatrique qui a récemment passé son HDR (novembre 2025) et rattachée à l''équipe Cimind. Le Dr Pochon développe une thématique basée sur les récepteurs chimériques d'antigène (CAR) avec comme plateforme les Lymphocytes T ou les NKT invariants. Le Pr Decot développe une thématique basée sur l'immunothérapie adoptive en hématologie et dans les tumeurs solides (LT gamma delta et cellules Nk), c'est pourquoi l'idée d'une collaboration a emergé sur l'expression de CAR sur des cellules alternatives aux LT conventionnels. Le doctorant sera suivi par des réunions bi-mensuelles avec ses encadrants (design des expériences, analyse des résultats, suite à donner aux experimentations, discussion sur l'integration du doctorant à l'équipe, ressenti vis à vis du sujet et du rythme de travail). Parallèlement le doctorant suivra des formations et enseignements lui permettant de valider les ECTS nécessaires pour sa thèse et des formations avec les techniciens et ingénieurs de l'équipe sur les différents instruments nécessaires pour son projet. Un projet de revue sera proposé au doctorant, ce qui lui permettra de synthétiser la littérature sur son sujet doctoral. Le doctorant suivra également au sein de l'équipe cimind, les réunions bi-mensuelles de l'équipe et plus généralement assistera aux séminaires de l'unité IMoPa. Une formation à l'expérimentation animale sera également proposée au doctorant. Les résultats seront valorisés tout au long de la thèse par des soumissions de résumé à des congrès ou colloque pour des communications affichées puis orales et par la rédaction d'articles.
Type de contrat
école doctorale
équipe
Equipe 6 : Cell-engineering and Immunomodulation of Inflammatoryand Neoplastic Disorders (CImINDcontexte
1) Constat scientifique à l'origine du projet : pertinence, originalité, utilité : La leucémie aiguë lymphoblastique (LAL) est l'hémopathie maligne la plus fréquente chez les enfants et adolescents. Elle touche les progéniteurs lymphoides immatures soit de la lignée B (LAL-B) ou T (LAL-T). Depuis quelques années, des progrès significatifs ont été faits dans sa prise en charge. Cette amélioration est principalement attribuée à des traitements de première ligne optimisés et à une stratification des risques intégrant le profilage génétique et la maladie résiduelle mesurable (MRD). Par conséquent, les résultats des patients atteints de leucémie aiguë lymphoblastique T (LAL-T) se rapprochent désormais de ceux observés pour la leucémie aiguë lymphoblastique à cellules B (LAL-B). Cependant, le pronostic des patients atteints de LAL-T réfractaire ou en rechute (R/R) demeure sombre, soulignant un besoin clinique critique non satisfait (1). Parmi les nouvelles approches thérapeutiques, l'émergence des immunothérapies cellulaires, notamment les lymphocytes T (LT) exprimant des récepteurs chimériques d'antigène (CAR-T cells) dirigés contre le CD19, a révolutionné la prise en charge des LAL-B . Parmi les cibles explorées dans la LAL-T, CD7, une glycoprotéine transmembranaire, apparaît comme l'un des antigènes les plus pertinents, car il est exprimé de façon homogène et stable à la surface des blastes leucémiques2 y compris dans les contextes de rechute ou de leucémies réfractaires. A ce jour, 10 essais cliniques de phase I (182 patients) ont évalué l'efficacité des LT CAR-CD7 autologues ou allogéniques3. Le taux de rémission complète était compris entre 31 et 100% avec pour effets secondaires les plus fréquents, le syndrome de relargage cytokinique et les cytopénies. Cependant, leur application aux leucémies T demeure limitée par des verrous biologiques majeurs : (i) le fratricide lié à l'expression partagée des antigènes cibles entre cellules tumorales et lymphocytes T effecteurs, nécessitant des modifications génétiques supplémentaires afin de moduler l'expression du CD7, (ii) l'aplasie T prolongée induite par la destruction des lymphocytes T normaux, (iii) le risque de maladie du greffon contre l'hôte (GVH) dans les approches allogéniques et (iv) le risque de contamination du produit par des blastes T en cas d'approche autologue. Si des solutions ont été développées pour contrer la fratricide (Knock-out du CD74, rétention intracellulaire de la molécule, utilisation d'ibrutinib (5), les LT CAR-anti-CD7 conservent les inconvénients liés à leur plateforme basée sur majoritairement sur les LT αβ. Les lymphocytes T gamma delta (T γδ) pourraient être considérés comme une plateforme alternative. Ils constituent une sous-population non conventionnelle de lymphocytes T, représentant 1 à 10 % des lymphocytes T circulants. Ils se distinguent par une reconnaissance antigénique indépendante du complexe majeur d'histocompatibilité (CMH), une activité cytotoxique innée-like et un faible potentiel alloréactif6,7. Plusieurs études précliniques et cliniques suggèrent que les T γδ sont associés à un risque réduit de GVH et peuvent être utilisés dans des contextes allogéniques et servir également de plateforme pour l'expression de CAR8. Dans ce contexte, l'ingénierie de lymphocytes T γδ exprimant un CAR anti-CD7 représente une stratégie innovante permettant de contourner les limitations des CAR-T αβ tout en combinant immunité innée et adaptative. Cette approche s'inscrit à l'interface de la recherche fondamentale et translationnelle, avec un fort potentiel de valorisation clinique. Malgré leur potentiel, les propriétés biologiques fondamentales des lymphocytes T γδ exprimant un CAR restent encore peu caractérisées. En particulier, les mécanismes de cytotoxicité, la persistance fonctionnelle, le risque de fratricide résiduel et l'impact de l'ingénierie CAR sur la biologie propre des T γδ demeurent insuffisamment explorés. Hypothèse centrale : les lymphocytes T γδ modifiés pour exprimer un CAR anti-CD7 conservent leurs propriétés immunologiques intrinsèques tout en acquérant une activité cytotoxique renforcée et spécifique contre les cellules de LAL-T, avec un profil de sécurité supérieur aux CAR-T αβ conventionnels, et un usage allogénique permettant la création de banques de CAR T γδ prêts à leur utilisation.spécialité
Sciences de la Vie et de la Santé - BioSElaboratoire
IMoPA - Ingénierie Moléculaire et Physiopathologie Articulaire
Mots clés
Leucémie aigüe lymphoblastique LAL-T, Lymphocyte T gamma delta, CD7, recepteur chimerique d'antigène, immunothérapie
Détail de l'offre
La leucémie aiguë lymphoblastique T (LAL-T) est une hémopathie maligne agressive associée à un pronostic défavorable en cas de rechute. Si les thérapies par lymphocytes T modifiés par récepteur chimérique d'antigène (CAR-T) ont transformé la prise en charge des hémopathies B, leur application aux leucémies T reste limitée par des obstacles majeurs, notamment le fratricide liée au ciblage d'antigènes partagés entre cellules tumorales et lymphocytes T normaux, l'aplasie T prolongée et le risque d'alloréactivité.
CD7 est exprimé de façon homogène sur la majorité des blastes de LAL-T et constitue une cible thérapeutique pertinente. Cependant, son expression sur les lymphocytes T conventionnels rend complexe le développement de CAR-T αβ anti-CD7. Les lymphocytes T gamma delta (T γδ), sous-population non conventionnelle dotée d'une reconnaissance antigénique largement indépendante du CMH et d'un faible potentiel alloréactif, représentent une plateforme prometteuse pour le développement de thérapies cellulaires innovantes.
Ce projet vise à développer et caractériser des lymphocytes T γδ exprimant un CAR anti-CD7. L'hypothèse principale est que les LT γδ CAR anti-CD7 conserveraient leurs propriétés biologiques intrinsèques tout en acquérant une activité cytotoxique renforcée et spécifique contre les cellules tumorales de LAL-T, avec un profil de sécurité amélioré.
L'axe 1 consistera à générer des LT γδ CAR anti-CD7 et à analyser leur phénotype, leur stabilité et l'impact de l'ingénierie sur leur biologie. L' axe 2 portera sur l'activité fonctionnelle in vitro, incluant des tests de cytotoxicité, et évaluation de la production de cytokines en comparaison avec des CAR-T αβ. L' axe 3 mécanistique analysera l'impact du CAR sur la signalisation intracellulaire (phosphoflow), les programmes transcriptionnels (single cell) et le métabolisme cellulaire.
Enfin, l'axe 4 sera consacré à la validation préclinique sera réalisée dans des modèles murins xénogreffés de LAL-T afin d'évaluer l'efficacité antitumorale, la persistance in vivo et la toxicité.
Ce projet devrait permettre de mieux comprendre la biologie des T γδ modifiés par CAR et d'établir une preuve de concept préclinique en vue d'un développement translationnel. À terme, cette stratégie pourrait ouvrir la voie à des approches d'immunothérapie cellulaire plus sûres et potentiellement « off-the-shelf » pour les patients atteints de LAL-T en situation d'échec thérapeutique.
Keywords
T-cell acute lymphoid leukemia, gamma delta T cells, CD7, chimeric antigen receptor, immunotherapy
Subject details
T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL) is an aggressive hematological malignancy associated with a poor prognosis in the case of relapse. While chimeric antigen receptor-modified T-cell (CAR-T) therapies have transformed the management of B-cell malignancies, their application to T-cell leukemias remains limited by major hurdles, including fratricidia due to the targeting of antigens shared between tumor cells and normal T lymphocytes, prolonged T-cell aplasia, and the risk of alloreactivity. CD7 is an antigen expressed homogeneously on the majority of T-ALL blasts and constitutes a relevant therapeutic target. However, its expression on conventional T lymphocytes complicates the development of anti-CD7 αβ CAR-T cells. Gamma delta T cells (γδ T cells), an unconventional subpopulation with antigen recognition largely independent of the MHC and low alloreactive potential, represent a promising platform for the development of innovative cell therapies. This project aims to develop and characterize γδ T cells expressing an anti-CD7 CAR T cell. The main hypothesis is that these anti-CD7 CAR T cells will retain their intrinsic biological properties while acquiring enhanced and specific cytotoxic activity against T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL) tumor cells, with an improved safety profile. Axis 1 will consist of generating anti-CD7 CAR T cells and analyzing their phenotype, stability, and the impact of engineering on their biology. A dedicated experimental design will allow for the evaluation of fratricidia by multiparametric flow cytometry, apoptosis analyses, and differential co-culture assays. Axis 2 will focus on in vitro functional activity, including cytotoxicity assays and cytokine production in comparison with αβ CAR T cells. Mechanistic axis 3 will analyze the impact of CAR on intracellular signaling (phosphoflow), transcriptional programs (single-cell), and cellular metabolism to identify molecular determinants of persistence and efficacy. Finally, preclinical validation(Axe 4) will be performed in xenografted murine models of T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL) to evaluate antitumor efficacy, in vivo persistence, and toxicity. This project should lead to a better understanding of the biology of CAR-modified γδ T cells and establish a preclinical proof of concept for translational development. Ultimately, this strategy could pave the way for safer and potentially off-the-shelf cell-based immunotherapy approaches for patients with T-ALL who have failed other therapies.
Profil du candidat
Etudiant de formation scientifique, pharmaceutique ou médicale
titulaire d'un Master 2 en Sciences de la vie et de la Santé ou équivalent
disposant de solide connaissances expérimentales en culture cellulaire, cytométrie en flux, téchniques de dosage type ELISA, selection immunomagnétique, co-culture...
Des connaissances théoriques d'immunologie, de cancérologie, de thérapie génique sont nécessaires à la prise en main du sujet doctoral.
Le doctorant devra également avoir de bonnes capacités de synthèse, être capable de mener des recherches bibliographiques, de concevoir des expériences.
le doctorant devra également avoir une bonne maitrise de l'anglais, écrit et parlé.
Candidate profile
A student with a scientific, pharmaceutical, or medical background
holding a Master's degree (or equivalent) in Life and Health Sciences
possessing strong experimental skills in cell culture, flow cytometry, ELISA-type assay techniques, immunomagnetic selection, co-culture, etc.
Theoretical knowledge of immunology, oncology, and gene therapy is necessary to undertake the doctoral research.
The doctoral candidate must also have strong analytical skills, be able to conduct literature reviews, and design experiments.
The doctoral candidate must also have a good command of written and spoken English.
Référence biblio
Bibliographie
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8. Fang, X., Yan, S., He, L., and Deng, C. (2025). CAR-γδ T cells: a new paradigm of programmable innate immune sentinels and their systemic applications in cancer and beyond. Front Immunol 16, 1735763. https://doi.org/10.3389/fimmu.2025.1735763.