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ANR - Gestion territoriale des étangs pour l'optimisation des performances économiques et environnementales de la pisciculture dans un contexte de changement climatique

Offre de thèse

ANR - Gestion territoriale des étangs pour l'optimisation des performances économiques et environnementales de la pisciculture dans un contexte de changement climatique

Date limite de candidature

31-08-2026

Date de début de contrat

01-11-2026

Directeur de thèse

LECOCQ Thomas

Encadrement

Co-directeurs: Joël Aubin (INRAE; Research Engineer HDR) Co-encadrants: Joël Robin (ISARA, Associate Professor HDR); Killian Chary (CIRAD, Researcher) Modalités de pilotage, coordination et implication du doctorant Le doctorant sera inscrit à l'école doctorale SIReNA de l'Université de Lorraine, au sein de l'équipe DAC (L2A), sous la direction scientifique de Thomas Lecocq (L2A-DAC) et la codirection de Joël Aubin (UMR SAS). Deux autres chercheurs participeront activement à ce projet doctoral : Joël Robin (ISARA) et Killian Chary (UMR ISEM-AQUABIOS). Le doctorant bénéficiera également de l'appui d'un comité de suivi de thèse, incluant des partenaires du projet CEDRE, pour accompagner la progression scientifique, méthodologique et expérimentale. Le doctorant réalisera plusieurs séjours longs au sein des partenaires : • ISARA (3 mois, 1ère année) : structuration des données de production et hydrologie (supervision Joël Robin) • UMR SAS, Rennes (3 mois, fin 1ère année) : modélisation trophique (supervision Joël Aubin) • AQUABIOS-ISEM (3 mois, 2ᵉ année) : développement des modèles territoriaux (supervision Killian Chary) Le doctorant interagira également avec les pisciculteurs (Filière Aquacole du Grand Est, FAGE ; Association de Promotion du Poisson des Etangs de la Dombes, APPED) et coanimera avec Joël Robin les ateliers participatifs avec les parties prenantes, garantissant l'intégration de la dimension socio-économique et terrain. Un comité de pilotage, animé par Thomas Lecocq, sera composé de Joël Aubin, Joël Robin et Killian Chary. Des représentants des acteurs professionnels (Yannick Jouan, FAGE ; Jules Blanc, APPED) seront invités à participer. Le comité se réunira trimestriellement pour suivre l'avancement, coordonner la valorisation des résultats et ajuster le projet si nécessaire. Des réunions techniques régulières avec les acteurs de terrain assureront la mise en œuvre et le suivi des scénarios expérimentaux et la prise en compte des contraintes locales. Enfin, un plan de contingence sera établi pour anticiper les éventuels retards (ex : accès limité aux données, difficultés techniques), avec des réunions de réajustement trimestrielles incluant les partenaires. Implication et formation du doctorant Le doctorant sera formé à : • Analyses bioinformatiques et modélisation prédictive basée sur les traits fonctionnels (L2A-DAC) • Évaluation environnementale et multicritère ; Modélisation trophique (UMR SAS) • Modélisation des flux inter-systèmes (UMR ISEM-AQUABIOS) • Coconstruction avec les parties prenantes et exploitation de bases de données territoriales (ISARA) Cette approche garantit une formation interdisciplinaire complète, renforçant l'employabilité du doctorant dans les secteurs académique et socio-économique.

Type de contrat

ANR Financement d'Agences de financement de la recherche

école doctorale

SIReNa - SCIENCE ET INGENIERIE DES RESSOURCES NATURELLES

équipe

contexte

Aquaculture must address major global challenges, including climate change, resource scarcity, economic concerns, and biodiversity conservation. Pond systems are complex socio-ecological systems influenced by hydrology, ecological interactions, and human decisions. The CEDRE project promotes integrated livestock systems at territorial scale, but aquaculture remains insufficiently studied within this framework. The PhD thesis fills this gap by integrating aquaculture into agroecological system design, combining ecological modelling, socio-economic analysis, and participatory approaches.

spécialité

Sciences agronomiques

laboratoire

L2A_Laboratoire Animal et Agroécosystèmes

Mots clés

Aquaculture, Modélisation

Détail de l'offre

Le projet de doctorat vise à renforcer la durabilité et la résilience des systèmes aquacoles en étangs face au changement climatique en passant d'une logique d'optimisation à l'échelle de l'étang à une gestion à l'échelle du territoire. Le projet intègre la co-conception participative, la modélisation multi-échelle (bioéconomique, hydrologique et écologique) ainsi que l'évaluation multicritère afin de développer des scénarios de gestion innovants.Inscrit dans le cadre du projet CEDRE, ce travail doctoral contribue à la conception de systèmes d'élevage intégrés en incorporant l'aquaculture dans des cadres agroécologiques territoriaux. Le doctorant développera des modèles permettant de simuler les flux d'eau, de nutriments et de biodiversité au sein de réseaux d'étangs, puis d'évaluer leurs performances au regard de contraintes environnementales et économiques.Les résultats fourniront des outils d'aide à la décision destinés aux acteurs du secteur et contribueront au développement d'une aquaculture durable dans l'Est de la France ainsi qu'au-delà de ce territoire.

Keywords

Aqauculture, modelling

Subject details

The PhD project aims to enhance the sustainability and resilience of pond aquaculture systems under climate change by shifting from pond-scale optimization to territorial management. The project integrates participatory co-design, multi-scale modelling (bioeconomic, hydrological, ecological), and multi-criteria evaluation to develop innovative management scenarios. Embedded in the CEDRE project, the PhD project contributes to the design of integrated livestock systems by incorporating aquaculture into territorial agroecological frameworks. The PhD will develop models simulating water, nutrient, and biodiversity flows across pond networks and evaluate their performance under environmental and economic constraints. The results will provide decision-support tools for stakeholders and contribute to sustainable aquaculture development in Eastern France and beyond.

Profil du candidat

Nous recherchons un(e) candidat(e) curieux(se) et motivé(e), titulaire d'un Master (MSc) en écologie aquatique, aquaculture, sciences de l'environnement, agronomie ou dans une discipline connexe.
Les compétences et centres d'intérêt recherchés sont :
- Connaissances en modélisation mécaniste, en statistiques, en SIG (Systèmes d'Information Géographique) et/ou en analyse des systèmes socio-techniques ;
- Fort intérêt pour la recherche interdisciplinaire ;
Intérêt pour les approches participatives et l'implication des parties prenantes ;
- Capacité à travailler dans un environnement international et collaboratif.

Candidate profile

sciences, agronomy, or a related field. The desired skills and interests are:
• Knowledge in mechanistic modelling, statistics, SIG, and/or socio-technical/systems analysis
• Strong interest in interdisciplinary research
• Interest in participatory approaches and stakeholder engagement
• Ability to work in an international and collaborative environment

Référence biblio

Lecocq, T., Amoussou, N., Aubin, J., Butruille, G., Liarte, S., Pasquet, A., & Thomas, M. (2024). Stronger together: A workflow to design new fish polycultures. Reviews in Aquaculture, 16(3), 1374–1394. https://doi.org/10.1111/raq.12903
Thomas, M., Pasquet, A., Aubin, J., Nahon, S., & Lecocq, T. (2021). When more is more: taking advantage of species diversity to move towards sustainable aquaculture. Biological Reviews, 96(2), 767–784. https://doi.org/10.1111/brv.12677
Ralien P.R., Larivain A., Roucaute M., Corson M.S., Pannard A., Robin J., Girard L., Guérin M., Rouifed S., Thomas M., Lecocq T., Coudreuse J., Nahon S., Kabir K.A., Aubin J., 2026. Effects of farming practices on the performance of fish pond polyculture assessed by trophic modelling. Journal of the World Aquaculture Society. (Accepted)