Offre de thèse
CD Dissémination de Gènes de Résistance aux Antibiotiques sous l'effet d'un Stress de l'hôte au sein du Microbiote Intestinal
Date limite de candidature
07-06-2024
Date de début de contrat
01-10-2024
Directeur de thèse
CAILLIEZ-GRIMAL Catherine
Encadrement
2 co-encadrantes CSI Réunions : hebdomadaires avec les encadrantes, trimestrielles et selon les besoins avec les collaborateurs, bi-annuelles à l'ensemble du laboratoire
Type de contrat
école doctorale
équipe
contexte
Dissémination de Gènes de Résistance aux Antibiotiques sous l'effet d'un Stress de l'hôte au sein du Microbiote Intestinalspécialité
Sciences de la Vie et de la Santé - BioSElaboratoire
SIMPA - Stress, Immunité, PathogènesMots clés
résistance aux antibiotiques, transfert horizontal de gènes
Détail de l'offre
La lutte contre l'émergence et la dissémination des résistances aux antibiotiques représente un des plus grands défis de l'humanité pour les années à venir. En effet, les scénarios les plus alarmants prédisent que les infections impliquant des bactéries résistantes aux antibiotiques deviendront la première cause de mortalité à l'horizon 2050. Le microbiote intestinal humain et animal représente à la fois un réservoir majeur de gènes de résistance aux antibiotiques ainsi qu'un environnement a priori extrêmement favorable à la dissémination de cette résistance. Sur la base de résultats obtenus in vitro, il a été suggéré que des molécules de stress présentes dans l'intestin, les catécholamines, pourraient augmenter la fréquence de conjugaison inter-bactérienne et de ce fait les transferts de gènes de résistance aux antibiotiques au sein du microbiote intestinal. Nos objectifs sont donc dans un premier temps de mettre en place un modèle murin innovant permettant de détecter et quantifier des évènements de transferts plasmidiques au sein du microbiote intestinal natif afin, dans un second temps, d'évaluer in vivo l'impact d'un stress chronique sur la fréquence de ces transferts. Les résultats obtenus permettront de mieux comprendre les mécanismes d'émergence et de dissémination des résistances aux antibiotiques chez les bactéries impliquées en pathologie humaine et d'envisager des contremesures à cette dissémination
Keywords
antibiotic resistance, horizontal gene transfer
Subject details
According to recent predictions, controlling the dissemination of antibiotic resistance may become one of the biggest health challenges faced by mankind in the coming years. Worse case scenarios are already predicting 10 million annual deaths on earth by 2050 because of our inability to treat bacterial infectious diseases that were formerly curable. Interestingly, the gut microbiota represents a major reservoir of antibiotic resistance genes as well as an extremely favorable environment for horizontal gene transfers between bacteria. An in vitro study has shown that stress mediators released in the intestinal lumen, such as norepinephrine, stimulate the transfer of a conjugative plasmid between enterobacteria, participating to the dissemination of antibiotic resistance. The difficulty of evaluating this phenomenon in vivo within the microbiota lies mainly in the ability to detect all the resistance gene transfer events that can occur in this complex ecosystem. Our project is to develop a model for detecting and quantifying such transfers in the native murine gut that could be used to evaluate the influence of chronic stress on their frequency. The results obtained will led to a better understanding of the mechanisms of emergence and dissemination of antibiotic resistance in bacteria involved in human pathology, as well as consider countermeasures against the stress-induced dissemination.
Profil du candidat
Cursus de microbiologie avec un bon niveau en bactériologie (bon classement M1 et M2)
Expérience en microbiologie phénotypique et moléculaire
Candidat motivé, capable d'esprit de synthèse, curieux, autonome, capable de travailler en équipe, avec un bon niveau d'anglais, bonne aptitude à l'oral et à l'écrit.
Candidate profile
Master of microbiology with a good level in bacteriology (candidate's marks and rankings in M1 and M2)
Experience in phenotypic and molecular microbiology
Motivated candidate, capable of synthesis, curious, autonomous, able to work in a team, english proficiency
Référence biblio
Alauzet C, Cunat L, Wack M, Lozniewski A, Busby H, Agrinier N, Cailliez-Grimal C, Frippiat J-P. 2019. Hypergravity disrupts murine intestinal microbiota. Scientific reports. Jun 28;9(1):9410. https://doi.org/10.1038/s41598-019-45153.
Alauzet C, Cunat L, Wack M, Lanfumey L, Legrand-Frossi C, Lozniewski A, Agrinier N, Cailliez-Grimal C, Frippiat JP. 2020. Impact of a Model Used to Simulate Chronic Socio-Environmental Stressors Encountered during Spaceflight on Murine Intestinal Microbiota. Int J Mol Sci. 21(21):E7863