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CD Hydroxylation des ARN: Caractérisation mécanistique et fonctionnelle des catalyseurs enzymatiques

Offre de thèse

CD Hydroxylation des ARN: Caractérisation mécanistique et fonctionnelle des catalyseurs enzymatiques

Date limite de candidature

01-06-2025

Date de début de contrat

01-10-2025

Directeur de thèse

BOSCHI-MULLER Sandrine

Encadrement

L'accueil de doctorants fait partie intégrante de la stratégie du laboratoire IMoPA qui a pour but non seulement de développer des recherches de pointe mais également de participer à la formation des jeunes chercheurs à travers l'accueil de doctorants et de post-doctorants. L'étudiant(e) recruté(e) fera partie intégrante de l'équipe Epiredox et participera à ce titre aux réunions de groupe (hebdomadaires), d'équipe et de laboratoire (bimensuelles). Il/elle sera encadré(e) au niveau théorique et conceptuel mais aussi pratique à toutes les étapes de développement des différents volets du projet, en favorisant sa prise d'autonomie scientifique. Dès son arrivée il/elle suivra la formation sur le didacticiel du CNRS à la sécurité et à la prévention, au risque incendie, au risque chimique et au risque biologique. Il/elle aura l'occasion de participer à au moins un congrès national et un congrès international, sera co-signataire de tous les articles/revues issues de ses travaux et sera parrainé(e) par 2 scientifiques extérieurs à l'unité (comité de thèse). Il/elle bénéficiera également d'un accompagnement par l'Ecole Doctorale Biose, guidé par ses encadrants, via des formations scientifiques (séminaires, modules de M2, formation à l'éthique de la recherche et à l'intégrité scientifique...) et/ou professionnalisantes (entretiens individuels, Doctoriales, DCCE, diffusion scientifique…). Il/elle aura l'opportunité d'enseigner dans le secteur Biochimie Biologie Moléculaire de l'Université (Section 64), et d'encadrer des stagiaires dès sa deuxième année de thèse. Les directeurs de thèse accompagneront le(la) doctorant(e) dans l'écriture scientifique (rapports, articles, manuscrit de thèse) et dans la préparation des oraux (séminaires internes, congrès et soutenance). Il/elle sera également associé à la rédaction des demandes de subventions. Le(la) doctorant(e) pourra à la suite de son doctorat soit continuer à se spécialiser en recherche fondamentale à travers un stage post-doctoral en France ou à l'étranger s'il souhaite embrasser une carrière académique, soit se tourner vers la recherche privée et/ou la création d'entreprise. Le doctorant bénéficiera de notre réseau de collaborateurs et de collègues de la communauté en enzymologie et modification des ARN (groupe Enzymes et SIFRARN de la SFBBM par exemple), et des exemples d'initiatives de maturation entrepreneuriale menées au sein du groupe. 

Type de contrat

Concours pour un contrat doctoral

école doctorale

BioSE - Biologie Santé Environnement

équipe

Equipe 3 : Enzymologie Redox Multiéchelle et Epitranscriptomique (EpiRedOx)

contexte

Ce projet fait partie des thématiques de l'équipe EpiRedox et il s'appuie sur les compétences de l'équipe incluant les approches de cinétiques classiques et rapides, de biophysico-chimie, d'ingénierie protéique, de biologie moléculaire et cellulaire et de séquençage à haut débit.

spécialité

Sciences de la Vie et de la Santé - BioSE

laboratoire

IMoPA - Ingénierie Moléculaire et Physiopathologie Articulaire

Mots clés

ARN, Enzyme, Hydroxylation, Interaction, Mécanisme moléculaire

Détail de l'offre

Les modifications des ARN jouent un rôle majeur dans l'expression génique, et leurs absences sont aujourd'hui reconnues comme associées chez l'Homme à différentes conditions physiopathologiques. Récemment, de nouvelles enzymes de modification des ARN, appartenant à différentes familles structurales, ont été identifiées chez les bactéries et pour lesquelles aucun mode d'action n'est connu au niveau moléculaire. Dans ce projet, nous allons développer des approches in vitro et in cellulo pour caractériser ces enzymes bactériennes et leur homologue Humain, afin de décrire leurs propriétés enzymatiques mais aussi leurs réseaux d'interactions, dans le but de décrypter leurs fonctions physiologiques.

Keywords

RNA, Enzyme, Hydroxylation, Interaction, Molecular mechanism

Subject details

RNA modifications play a major role in gene expression, and their absence is now recognized as being associated with various pathophysiological conditions in humans. Recently, new RNA-modifying enzymes belonging to different structural families have been identified in bacteria, for which there is no known informations at the molecular level. In this project, we will develop in vitro and in cellulo approaches to characterize these bacterial enzymes and their human counterpart, in order to describe their enzymatic properties as well as their interaction networks, with the aim of deciphering their physiological functions.

Profil du candidat

Compétences : Compétences solides en biochimie des protéines et génie génétique requises, des connaissances en biologie cellulaire seraient un plus
Qualités humaines : rigueur, autonomie, travail en équipe

Candidate profile

Skills: strong theoretical and practical protein biochemistry, genetic engineering, additional knowledges in cell biology would be appreciated.
Human qualities: rigor, autonomy, team spirit

Référence biblio

Alsohaibani R, Claudel A-L, Perchat-Varlet R, Boutserin S, Talfournier F, Boschi-Muller S, Selles B. 2023. Rhodanese-Fold Containing Proteins in Humans: Not Just Key Players in Sulfur Trafficking. Antioxidants 12, 843.
Selles B, Moseler A, Rouhier N, Couturier J. 2019. Rhodanese domain-containing sulfurtransferases: multifaceted proteins involved in sulfur trafficking in plants. Journal of Experimental Botany 70, 4139–4154.
Hertler J, Slama K, Schober B, Özrendeci Z, Marchand V, Motorin Y, Helm M. 2022. Synthesis of point-modified mRNA. Nucleic Acids Research 50, e115.
Lec J-C, Boutserin S, Mazon H, Mulliert G, Boschi-Muller S, Talfournier F. 2018. Unraveling the Mechanism of Cysteine Persulfide Formation Catalyzed by 3-Mercaptopyruvate Sulfurtransferases. ACS Catalysis 8, 2049–2059