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LUE - Décryptage de l'activité électrochimique du biochar dans les bioprocédés/Elucidation of the electrochemical activity of biochar in bioprocesses

Offre de thèse

LUE - Décryptage de l'activité électrochimique du biochar dans les bioprocédés/Elucidation of the electrochemical activity of biochar in bioprocesses

Date limite de candidature

30-04-2024

Date de début de contrat

01-10-2024

Directeur de thèse

ETIENNE Mathieu

Encadrement

Emmanuel Guedon, LRGP, emmanuel.guedon@univ-lorraine.fr

Type de contrat

Concours pour un contrat doctoral

école doctorale

C2MP - CHIMIE MECANIQUE MATERIAUX PHYSIQUE

équipe

Chimie et Electrochimie Analytiques

contexte

L'Université de Lorraine a collaboré avec la Washington State University (WSU) dans le cadre d'un programme Erasmus+ soutenu par le LCPME. Un projet de recherche international (financé par le CNRS et le LUE et piloté par le LRGP) est en cours sur la biomasse (2022-2026).

spécialité

Chimie

laboratoire

LCPME - Laboratoire de Chimie Physique et Microbiologie pour les Matériaux et l'Environnement

Mots clés

propriété de surface, électrochimie, bactérie, transfert d'électron extracellulaire, biofilm, biogaz

Détail de l'offre

Le projet de doctorat a pour ambition de clarifier la relation entre les propriétés du biochar, en particulier la conductivité et la réactivité électrochimique, l'écologie microbienne des biofilms se développant sur ce biochar et la production de biogaz dans les bioréacteurs enrichis avec ce biochar. En effet, il existe des rapports dans la littérature sur le rôle de l'amendement de biochar redox-actif/conducteur sur la production de biogaz dans les bioréacteurs anaérobies. L'une des limites de ces études réside dans la texture relativement complexe des matériaux particulaires qui ne permet pas d'effectuer des recherches fondamentales bien contrôlées dans le cadre d'une approche systématique.

Ce projet de doctorat propose d'initier l'étude en synthétisant des biochars bien définis à partir de sources de biomasse contrôlées (y compris des macromolécules de biomasse modèles) et dans des conditions de pyrolyse finement réglées (température, temps de séjour du solide, pression, etc.). Ces échantillons seront caractérisés avec une large gamme de techniques disponibles au LCPME, avant et après exposition à l'environnement anaérobie du méthaniseur de La Bouzule (ferme expérimentale de l'Université de Lorraine). Ces caractérisations incluent des techniques spécialisées telles que la microscopie électrochimique à balayage pour évaluer la réactivité électrochimique de surface qui est impliquée dans les interactions initiales avec les microbes.

Une sélection de biochar sera ensuite appliquée à la croissance de biofilms dans des conditions anaérobies imitant l'environnement d'un méthaniseur tel que celui de La Bouzule. L'ambition est ici d'obtenir une analyse taxonomique de la population microbienne, et d'étendre l'analyse à l'état transcriptionnel de la cellule, en analysant l'ARNm impliqué dans la production d'enzymes d'oxydoréduction.

La dernière étape expérimentale du projet impliquera des bioréacteurs anaérobies ensemencés avec du digestat issu du méthaniseur de La Bouzule, et alimentés avec une sélection de particules de biochar pour évaluer le rôle de cet amendement de biochar sur la production de biogaz, en particulier le ratio entre H2, CH4 et CO2. L'analyse des différents résultats et de la relation entre la production de biogaz, les propriétés du biochar et l'écologie microbienne sera effectuée à la fin du projet de doctorat.

Ce projet sera développé sous la direction de Mathieu ETIENNE (LCPME) et d'Emmanuel Guedon, (LRGP), en partenariat avec Anthony Dufour (LRGP) et Frédérique Changey (LCPME) et le groupe du Prof. Manuel Garcia-Perez de la Washington State University (WSU).

Le LCPME fournira des ressources pour la mesure électrochimique de la réactivité des surfaces et leur caractérisation, en utilisant une variété d'instruments de la plateforme de spectroscopie et de microscopie des interfaces, en particulier la microscopie à force atomique, la microscopie électrochimique à balayage, l'XPS et la spectrométrie Raman. Le LCPME fournira également des installations et une méthodologie pour l'analyse de l'écologie microbienne des biofilms (plate-forme de biologie moléculaire environnementale). Le LRGP fournira l'équipement et l'expertise nécessaires à l'élaboration de biochar de composition et de propriétés contrôlées et à l'analyse des gaz en ligne pour la détermination du rapport H2, CH4 et CO2, en collaboration avec la ferme expérimentale de La Bouzule. WSU apportera ses modèles moléculaires des structures du biochar et une compréhension approfondie des mécanismes biochimiques sur les surfaces du biochar.

Keywords

surface properties, electrochemistry, bacteria, extracellular electron transfer, biofilm, biogas

Subject details

The PhD project has the ambition to clarify the relationship between biochar properties, especially conductivity and electrochemical reactivity, microbial ecology of biofilms growing on this biochar and biogas production in bioreactors enriched with such biochar. Indeed, there is reports in the literature on the role of redox-active/conductive biochar amendment on the biogas production from anaerobic bioreactors. One limitation of such study lies on the relatively complex texture of the particle materials that does allow well controlled fundamental investigations in a systematic approach. This PhD project propose to initiate the study by synthesizing well-defined biochars from controlled biomass sources (including model biomass macromolecules) and under finely tuned pyrolysis conditions (temperature, residence time of the solid, pressure, etc.). These samples will be characterized with a wide range of techniques available at LCPME, before and after exposure to the anaerobic environment from the methanizer of La Bouzule (experimental farm of Université de Lorraine). These characterizations include specialized techniques such as scanning electrochemical microscopy to assess the surface electrochemical reactivity that is involved in the initial interactions with microbes. A selection of biochar will then be applied to biofilm growth in anaerobic conditions mimicking the environment of an methanizer such as the one of La Bouzule. The ambition is here to get a taxonomic analysis of the microbial population, and to extend the analysis to the transcriptional state of the cell, by analyzing the mRNA involved in redox enzyme production. The final experimental stage of the project will involve anaerobic bioreactors inoculated with digestates taken from the Bouzule methanizer, and fed with a selection of biochar particles for evaluating the role of this biochar amendment on the biogas production, especially the ratio between H2, CH4 and CO2. Analysis of the various results and the relationship between biogas production, biochar properties and microbial ecology will be carried out at the end of the PhD project, and will culminate in the publication of the thesis and scientific articles. If relevant, IP protection will be considered. This project will be developed under the supervision of Dr. Mathieu Etienne at LCPME and Dr. Emmanuel Guedon at LRGP, in collaboration with Dr. Anthony Dufour and Dr. Frédérique Changey at Université de Lorraine and the group of Prof. Manuel Garcia-Perez from Washington State University (WSU). LCPME will provide resources for electrochemical measurement of surface reactivity, especially with using a variety of instruments from the platform of spectroscopy and microscopy of interfaces, especially atomic force microscopy, scanning electrochemical microscopy, XPS and Raman spectrometry. LCPME will also provide facilities and methodology for microbial ecology analysis of biofilms (platform of environmental molecular biology). LRGP will provide equipment and expertise for elaboration of biochar of controlled composition and properties and online gas analysis for determination of the H2, CH4 and CO2 ratio, in collaboration with the experimental farm of La Bouzule. The project will also involve Prof. Manuel Garcia-Perez at WSU on the topic of biomass valorization. WSU will bring its extensive molecular models of biochar structures and a deep understanding on the biochemical mechanisms on biochar surfaces.

Profil du candidat

Ce projet est de nature pluridisciplinaire, le candidat aura préférentiellement une formation de base en physicochimie ou en sciences des matériaux et un fort intérêt pour les systèmes biologiques complexes.
Une formation de base en microbiologie ou en bioprocédé peut également convenir à ce projet mais l'étudiant devra démontrer un fort intérêt pour les analyses physicochimiques. Une première expérience en électrochimie ou en bioélectrochimie sera très appréciée.

Candidate profile

This project is multidisciplinary in nature, and the candidate will preferably have a background in physicochemistry or materials science and a strong interest in complex biological systems.
A background in microbiology or bioprocessing may also be suitable for this project, but the student should demonstrate a keen interest in physicochemical analysis. A first experience in electrochemistry or bioelectrochemistry would be highly appreciated.

Référence biblio

Publications entre partenaires de ce projet :
[1] D. Truong, F. Changey, E. Rondags, X. Framboisier, M. Etienne, E. Guedon, Evaluation of short-circuited electrodes in combination with dark fermentation for promoting biohydrogen production process, Bioelectrochemistry. 157 (2023) 108631. doi:10.1016/j.bioelechem.2023.108631.
[2] V. Sierra-Jimenez, J.P. Mathews, F. Chejne, A. Dufour, M. Garcia-Perez, Atomistic Modeling of Lignocellulosic and Carbonaceous Fuels and Their Pyrolysis Reactions: A Review, Energy and Fuels. 37 (2023) 18408–18440. doi:10.1021/acs.energyfuels.3c02901.
[3] E. Terrell, V. Carré, A. Dufour, F. Aubriet, Y. Le Brech, M. Garcia-Pérez, Contributions to Lignomics: Stochastic Generation of Oligomeric Lignin Structures for Interpretation of MALDI–FT-ICR-MS Results, 2020. doi:10.1002/cssc.202000239.
[4] Y. Han, A.P.P. Pires, M. Garcia-Perez, Co-hydrotreatment of the Bio-oil Lignin-Rich Fraction and Vegetable Oil, Energy and Fuels. 34 (2020) 516–529. doi:10.1021/acs.energyfuels.9b03344.
[5] F. Buendia-Kandia, C. Greenhalf, C. Barbiero, E. Guedon, C. Briens, F. Berruti, et al., Fermentation of cellulose pyrolysis oil by a Clostridial bacterium, Biomass and Bioenergy. 143 (2020). doi:10.1016/j.biombioe.2020.105884.
[6] F. Buendia-Kandia, G. Mauviel, E. Guedon, E. Rondags, D. Petitjean, A. Dufour, Decomposition of Cellulose in Hot-Compressed Water: Detailed Analysis of the Products and Effect of Operating Conditions, Energy and Fuels. 32 (2018) 4127–4138. doi:10.1021/acs.energyfuels.7b02994.